무좀은 곰팡이가 피부 표면에서 자라서 생기는 질환이므로 곰팡이의 성장을 억제시키는 약제(항진균제)를 사용하면 비교적 쉽게 치료할 수 있다. 보통 무좀이 잘 낫지 않는다고 하는 것은 불충분하게 치료했거나 재감염을 적절히 방지하지 못해서인 경우가 많다. 발가락 사이에만 생기는 무좀이나 물집이 생기는 무좀은 대부분 바르는 항진균제 연고만으로도 완치될 수 있다. 그러나 증상이 없어진 후에도 보름정도 약을 계속 발라야 잠복해 있는 무좀균을 모두 없앨 수 있다는 사실을 명심해야 한다.
발바닥 전체가 건조해지면서 두꺼워지는 형태의 무좀은 항진균제 연고를 바르는 것만으로 치료가 어려운 경우가 많다. 이런 경우에는 각질융화제를 함께 사용하는 것이 좋으며, 바르는 약만으로 잘 낫지 않아 먹는 무좀약(경구용 항진균제)을 사용해야 할 경우도 있다. 또 이런 형태의 무좀이 있는 경우 무좀균이 손톱이나 발톱에 침범하여 손톱이나 발톱이 두꺼워지고 쉽게 부스러지며 안쪽으로 점점 먹어 들어가는 조갑백선증이 동반되는 경우가 있는데, 조갑백선증의 치료는 최근 매니큐어 형태의 바르는 약이 개발되었으나 그 효과는 좀더 관찰해 보야햐 할 단계이며 현재까지는 먹는 무좀약을 사용해야 완치가 가능하다고 여겨진다. 먹는 무좀약은 간독성등의 부작용이 있을 수 있으므로 꼭 사용해야 할 경우에는 병원을 방문하는것이 좋다. 발톱이나 손톱밑에 잠복해 있는 곰팡이까지 완전히 없어져야 한다는 사실도 무좀 치료에 중요한 요소다.
무좀에 바르는 약, 특히 각질융화제가 포함된 약은 대부분 피부를 자극하거나 과민성이 있는 것들이어서 약제에 의한 이차적인 습진(접촉피부염) 을 유발하기도 한다. 따라서 물집이 생기거나 염증이 심한 형태의 무좀에는 각질융화제를 사용하지 않는 것이 좋다. 또 무좀으로 인한 피부 상처를 통해 화농성 세균의 이차감염이 발생하여 발이 부어오르고 통증이 심한 경우에는 아무리 좋은 무좀약을 바르거나 먹어도 소용이 없다.

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